قسم الجراحة مجهز بثلاث غرف عمليات على أحدث الأصول الطبية العالمية، كما يوجد بالقسم أكبر وأحدث وحدة تعقيم للآلات الجراحية من غسيل بالموجات فوق الصوتية وغسيل بالأحماض وتجفيف حراري وتعقيم وتغليف.
و جهاز Frozen Section    لتحليل عينات الأورام بدقه أثناء الجراحة
كما تم تجهيز الجمعية بجهاز موجات صوتية على القلب لمرضى العلاج الكيميائي والجراحة